配列名:SPI_r1.1
ゲノム配列名 | SPI_r1.1 | 系統名 | LA1670 |
配列数 | 14 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 808,801,754 | N50長 (bp) | 66,552,494 |
遺伝子の数 | 71,945 | 遺伝子数由来ファイル | SPI_r1.1.pep.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 71,945 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio | 取得した配列量 | 98x |
アセンブリ方法 | Falcon_Unzip | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 786 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Tohru Ariizumi (University of Tsukuba) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsaa029 | データソースURL | https://plantgarden.jp |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.5%[S:96.8%,D:0.7%],F:1.0%,M:1.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:82.3%[S:80.2%,D:2.1%],F:7.4%,M:10.3%,n:1614 |