Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Solanum chilense , Wild tomato (chilense) , トマト野生種 (chilense種)

Solanum chilense

Genome Assembly ID:t4083.G001

配列名:ASM601370v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM601370v1 系統名 LA3111
配列数 81,304 染色体数 NA
配列長 (bp) 913,880,739 N50長 (bp) 70,632
遺伝子の数 25,885 遺伝子数由来ファイル GCA_006013705.1_ASM601370v1_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 130x
アセンブリ方法 Celera assembler v8.3 推定ゲノムサイズ (Mb) 950
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Remco Stam (Technical University Munich) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1534/g3.119.400529 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット