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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Datura stramonium , Jimson weed, Common thornapple , ヨウシュチョウセンアサガオ

Datura stramonium

Genome Assembly ID:t4076.G001

配列名:UCR_Dstr_1.4

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 UCR_Dstr_1.4 系統名 NA
配列数 232,580 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 2,110,457,301 N50長 (bp) 164,097
遺伝子の数 52,106 遺伝子数由来ファイル GCA_018107945.1_UCR_Dstr_1.4_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 llumina, Nanopore MinION 取得した配列量 90.0x
アセンブリ方法 ABySS v. 2.0.2 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,000
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Amy Litt (University of California) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1186/s12864-021-07489-2 データソースURL https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA/018/107/945/GCA_018107945.1_UCR_Dstr_1.4/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:96.6%[S:94.9%,D:1.7%],F:2.1%,M:1.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:85.6%[S:84.1%,D:1.5%],F:9.6%,M:4.8%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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