配列名:UCR_Dstr_1.4
ゲノム配列名 | UCR_Dstr_1.4 | 系統名 | NA |
配列数 | 232,580 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 2,110,457,301 | N50長 (bp) | 164,097 |
遺伝子の数 | 52,106 | 遺伝子数由来ファイル | GCA_018107945.1_UCR_Dstr_1.4_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | llumina, Nanopore MinION | 取得した配列量 | 90.0x |
アセンブリ方法 | ABySS v. 2.0.2 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,000 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Amy Litt (University of California) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1186/s12864-021-07489-2 | データソースURL | https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA/018/107/945/GCA_018107945.1_UCR_Dstr_1.4/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:96.6%[S:94.9%,D:1.7%],F:2.1%,M:1.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:85.6%[S:84.1%,D:1.5%],F:9.6%,M:4.8%,n:1614 |