配列名:Capsicum.annuum.var.glabriusculum_Chiltepin_Release_2.0
ゲノム配列名 | Capsicum.annuum.var.glabriusculum_Chiltepin_Release_2.0 | 系統名 | var. glabriusculum, common-name Chiltepin |
配列数 | 13 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 3,528,040,346 | N50長 (bp) | 229,064,124 |
遺伝子の数 | 34,476 | 遺伝子数由来ファイル | Capsicum.annuum.var.glabriusculum_Chiltepin_v2.0_PEP.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 34,476 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 66x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 1.06 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 3,070 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Luis Herrera-Estrella (Centro de Investigacion y de Estudios Avanzados del Instituto Politecnico Nacional), Ye Yin (Beijing Genomics Institute-Shenzhen), Jiping Yu (Zunyi Academy of Agricultural Sciences), Kailin Hu (South China Agricultural University), Z | データソース名 | Pepper Genome Database website |
論文 (DOIコード) | 10.1073/pnas.1400975111 | データソースURL | http://peppersequence.genomics.cn |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.0%[S:94.7%,D:2.3%],F:1.9%,M:1.1%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:78.5%[S:75.5%,D:3.0%],F:10.6%,M:10.9%,n:1614 |