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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Catharanthus roseus , Chatas, Chula, Old-maid, Rosy periwinkle, Madagascar periwinkle , ニチニチソウ

Catharanthus roseus

Genome Assembly ID:t4058.G002

配列名:cro_v2_asm

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 cro_v2_asm 系統名 NA
配列数 2,090 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 541,127,784 N50長 (bp) 2,579,454
遺伝子の数 34,363 遺伝子数由来ファイル cro_v2.proteins.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 212Mb (Paired end reads), 94Mb (mate pair reads)
アセンブリ方法 ALLPATHS-LG v. v52188 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sarah E. O'Connor (John Innes Centre) データソース名 DRYAD
論文 (DOIコード) 10.1002/cbic.201800592 データソースURL https://datadryad.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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