配列名:TMA_r1.1
ゲノム配列名 | TMA_r1.1 | 系統名 | NA |
配列数 | 14 | 染色体数 | NA |
配列長 (bp) | 161,116,788 | N50長 (bp) | 12,376,747 |
遺伝子の数 | 21,915 | 遺伝子数由来ファイル | TMA_r1.1.pep.fasta.gz + Tma1.0mito.pep.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 21,887 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio II HiFi | 取得した配列量 | 64x |
アセンブリ方法 | Hifiasm | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 149 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Res Inst) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsad006 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.2.2 | BUSCO データセット | fungi_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.7%[S:96.4%,D:1.3%],F:0.3%,M:2.0%,n:758 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.5%[S:94.3%,D:1.2%],F:0.7%,M:3.8%,n:758 |