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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Tricholoma matsutake , Matsutake , マツタケ

Tricholoma matsutake

Genome Assembly ID:t40145.G001

配列名:TMA_r1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 TMA_r1.1 系統名 NA
配列数 14 染色体数 NA
配列長 (bp) 161,116,788 N50長 (bp) 12,376,747
遺伝子の数 21,915 遺伝子数由来ファイル TMA_r1.1.pep.fasta.gz + Tma1.0mito.pep.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 21,887 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio II HiFi 取得した配列量 64x
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) 149
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Res Inst) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsad006 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.2.2 BUSCO データセット fungi_odb10
BUSCO ゲノム C:97.7%[S:96.4%,D:1.3%],F:0.3%,M:2.0%,n:758 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:95.5%[S:94.3%,D:1.2%],F:0.7%,M:3.8%,n:758

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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