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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Manihot esculenta , Cassava , キャッサバ

Manihot esculenta

Genome Assembly ID:t3983.G004

配列名:TME204.HiFi_HiC_allmap.hap2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 TME204.HiFi_HiC_allmap.hap2 系統名 cv. TME204
配列数 749 染色体数 2n = 2x = 36
配列長 (bp) 706,330,743 N50長 (bp) 34,234,626
遺伝子の数 83,122 遺伝子数由来ファイル TME204.hap2.v1.1.pep.complete.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Hi-C 取得した配列量 42x
アセンブリ方法 hifiasm v0.7 推定ゲノムサイズ (Mb) 750
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Wilhelm Gruissem (ETH Zurich) データソース名 GIGA DB
論文 (DOIコード) 10.1093/gigascience/giac028 データソースURL http://gigadb.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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