配列名:TME204.HiFi_HiC_allmap.hap1
ゲノム配列名 | TME204.HiFi_HiC_allmap.hap1 | 系統名 | cv. TME204 |
配列数 | 1,414 | 染色体数 | 2n = 2x = 36 |
配列長 (bp) | 762,395,283 | N50長 (bp) | 35,497,395 |
遺伝子の数 | 93,072 | 遺伝子数由来ファイル | TME204.hap1.v1.1.pep.complete.fasta.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel II, Hi-C | 取得した配列量 | 42x |
アセンブリ方法 | hifiasm v0.7 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 750 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Wilhelm Gruissem (ETH Zurich) | データソース名 | GIGA DB |
論文 (DOIコード) | 10.1093/gigascience/giac028 | データソースURL | http://gigadb.org/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |