配列名:M.esculenta_v8
ゲノム配列名 | M.esculenta_v8 | 系統名 | AM560-2 |
配列数 | 86 | 染色体数 | 2n = 2x = 36 |
配列長 (bp) | 640,430,993 | N50長 (bp) | 34,668,054 |
遺伝子の数 | 49,290 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_001659605.2_M.esculenta_v8_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio RSII; Sequel | 取得した配列量 | 97x |
アセンブリ方法 | Canu v. 1.6 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 740 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Bin Liu(Xinjiang Institute of Ecology and Geography), Kamian Li(Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences ), Ming Peng(Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences ) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ncomms6110 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.9%[S:92.8%,D:6.1%],F:0.7%,M:0.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.8%[S:53.0%,D:46.8%],F:0.1%,M:0.1%,n:1614 |