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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Manihot esculenta , Cassava , キャッサバ

Manihot esculenta

Genome Assembly ID:t3983.G002

配列名:M.esculenta_v8

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 M.esculenta_v8 系統名 AM560-2
配列数 86 染色体数 2n = 2x = 36
配列長 (bp) 640,430,993 N50長 (bp) 34,668,054
遺伝子の数 49,290 遺伝子数由来ファイル GCF_001659605.2_M.esculenta_v8_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RSII; Sequel 取得した配列量 97x
アセンブリ方法 Canu v. 1.6 推定ゲノムサイズ (Mb) 740
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Bin Liu(Xinjiang Institute of Ecology and Geography), Kamian Li(Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences ), Ming Peng(Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences ) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/ncomms6110 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.9%[S:92.8%,D:6.1%],F:0.7%,M:0.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.8%[S:53.0%,D:46.8%],F:0.1%,M:0.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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