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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Manihot esculenta , Cassava , キャッサバ

Manihot esculenta

Genome Assembly ID:t3983.G001

配列名:Manihot_esculenta_v6

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Manihot_esculenta_v6 系統名 AM560-2
配列数 2,019 染色体数 2n = 2x = 36
配列長 (bp) 582,117,524 N50長 (bp) 28,119,335
遺伝子の数 41,393 遺伝子数由来ファイル Manihot_esculenta.Manihot_esculenta_v6.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 41,393 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, CHICAGO 取得した配列量 121x
アセンブリ方法 Platanus v. 1.2.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 807
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Steve Rounsley (University of Arizona) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1007/s12042-011-9088-z データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.2%[S:92.6%,D:5.6%],F:1.1%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:95.5%[S:70.9%,D:24.6%],F:2.9%,M:1.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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