配列名:Manihot_esculenta_v6
ゲノム配列名 | Manihot_esculenta_v6 | 系統名 | AM560-2 |
配列数 | 2,019 | 染色体数 | 2n = 2x = 36 |
配列長 (bp) | 582,117,524 | N50長 (bp) | 28,119,335 |
遺伝子の数 | 41,393 | 遺伝子数由来ファイル | Manihot_esculenta.Manihot_esculenta_v6.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 41,393 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, CHICAGO | 取得した配列量 | 121x |
アセンブリ方法 | Platanus v. 1.2.1 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 807 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Steve Rounsley (University of Arizona) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1007/s12042-011-9088-z | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.2%[S:92.6%,D:5.6%],F:1.1%,M:0.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.5%[S:70.9%,D:24.6%],F:2.9%,M:1.6%,n:1614 |