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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Hevea brasiliensis , Rubber tree , パラゴムノキ

Hevea brasiliensis

Genome Assembly ID:t3981.G004

配列名:GCF_030052815.1_ASM3005281v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GCF_030052815.1_ASM3005281v1 系統名 IRRDB accession MT/VB/25A 57/8
配列数 755 染色体数 2n = 2x = 36
配列長 (bp) 1,876,651,409 N50長 (bp) 101,662,298
遺伝子の数 58,025 遺伝子数由来ファイル GCF_030052815.1_ASM3005281v1_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore, BioNano optical maps, Hi-C 取得した配列量 300x (ONT), 264x (BioNano), 135x (Hi-C)
アセンブリ方法 Nextdenovo, bowtie2 v2.3.2, LACHESIS 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,824
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Huasun Huang (Chinese Academy of Tropical Agricultural Science) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1111/pbi.14018 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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