配列名:Vunguiculata_540_v1.0
ゲノム配列名 | Vunguiculata_540_v1.0 | 系統名 | cv. IT97K-499-35 |
配列数 | 686 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 519,435,864 | N50長 (bp) | 41,684,185 |
遺伝子の数 | 54,484 | 遺伝子数由来ファイル | Vunguiculata_540_v1.2.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 54,484 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio; Bionano | 取得した配列量 | 91.0x |
アセンブリ方法 | CANU-Abruijn-FALCON v. 2017-2-1 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 586 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Stefano Lonardi (University of California), Maria Munoz-Amatriain(ditto) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1111/tpj.14349 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.9%[S:96.4%,D:2.5%],F:0.4%,M:0.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:98.9%[S:60.7%,D:38.2%],F:0.6%,M:0.5%,n:1614 |