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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Vigna unguiculata , Cowpea , ササゲ

Vigna unguiculata

Genome Assembly ID:t3917.G001

配列名:Vunguiculata_540_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Vunguiculata_540_v1.0 系統名 cv. IT97K-499-35
配列数 686 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 519,435,864 N50長 (bp) 41,684,185
遺伝子の数 54,484 遺伝子数由来ファイル Vunguiculata_540_v1.2.protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 54,484 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio; Bionano 取得した配列量 91.0x
アセンブリ方法 CANU-Abruijn-FALCON v. 2017-2-1 推定ゲノムサイズ (Mb) 586
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Stefano Lonardi (University of California), Maria Munoz-Amatriain(ditto) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.14349 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.9%[S:96.4%,D:2.5%],F:0.4%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:98.9%[S:60.7%,D:38.2%],F:0.6%,M:0.5%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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