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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Vigna angularis var. angularis , Adzuki bean (var. angularis) , アズキ (angularis変種)

Vigna angularis

Genome Assembly ID:t3914.G001

配列名:Vigan1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Vigan1.1 系統名 var. angularis, cv. Jingnong 6
配列数 37,373 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 466,744,453 N50長 (bp) 34,671,004
遺伝子の数 33,860 遺伝子数由来ファイル Vigna_angularis.Vigan1.1.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 33,860 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 167.67x
アセンブリ方法 SOAPdenovo 推定ゲノムサイズ (Mb) 538
シーケンシングの方法のコメント NA コメント var. angularis, cv. Jingnong 6
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Ping Wan (Beijing University of Agriculture), Rajeev K. Varshney (International Crops Research Institute for theSemi-Arid Tropics), Jun Wang (Beijing Genomics Institute-Shenzhen), Hong-Qing Ling (Chinese Academy of Science) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1073/pnas.1420949112 データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.5%[S:96.0%,D:2.5%],F:1.1%,M:0.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:84.0%[S:81.2%,D:2.8%],F:7.4%,M:8.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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