配列名:Vigan1.1
ゲノム配列名 | Vigan1.1 | 系統名 | var. angularis, cv. Jingnong 6 |
配列数 | 37,373 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 466,744,453 | N50長 (bp) | 34,671,004 |
遺伝子の数 | 33,860 | 遺伝子数由来ファイル | Vigna_angularis.Vigan1.1.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 33,860 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 167.67x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 538 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | var. angularis, cv. Jingnong 6 |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Ping Wan (Beijing University of Agriculture), Rajeev K. Varshney (International Crops Research Institute for theSemi-Arid Tropics), Jun Wang (Beijing Genomics Institute-Shenzhen), Hong-Qing Ling (Chinese Academy of Science) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1073/pnas.1420949112 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.5%[S:96.0%,D:2.5%],F:1.1%,M:0.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:84.0%[S:81.2%,D:2.8%],F:7.4%,M:8.6%,n:1614 |