配列名:VSA_r1.0
ゲノム配列名 | VSA_r1.0 | 系統名 | KSR5 |
配列数 | 54,083 | 染色体数 | 2n = 2x = 14 |
配列長 (bp) | 1,541,180,487 | N50長 (bp) | 90,105 |
遺伝子の数 | 31,146 | 遺伝子数由来ファイル | VSA_r1.0.proteins.noTE.rm_partial.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina HiSeq2000, PacBio RS II | 取得した配列量 | 216x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo2, PBJelly | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,769 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1101/2021.03.09.434686 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.8%[S:95.6%,D:2.2%],F:1.4%,M:0.8%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:86.3%[S:84.8%,D:1.5%],F:6.6%,M:7.1%,n:1614 |