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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Vicia sativa , Common vetch , ヤハズエンドウ

Vicia sativa

Genome Assembly ID:t3908.G001

配列名:VSA_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 VSA_r1.0 系統名 KSR5
配列数 54,083 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 1,541,180,487 N50長 (bp) 90,105
遺伝子の数 31,146 遺伝子数由来ファイル VSA_r1.0.proteins.noTE.rm_partial.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina HiSeq2000, PacBio RS II 取得した配列量 216x
アセンブリ方法 SOAPdenovo2, PBJelly 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,769
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2021.03.09.434686 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.8%[S:95.6%,D:2.2%],F:1.4%,M:0.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:86.3%[S:84.8%,D:1.5%],F:6.6%,M:7.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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