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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Vicia faba , Fava bean , ソラマメ

Vicia faba

Genome Assembly ID:t3906.G001

配列名:211010_Vfaba_split_pseudomolecules_hedin_v1pluschlro_clean_unanchored_contigs

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 211010_Vfaba_split_pseudomolecules_hedin_v1pluschlro_clean_unanchored_contigs 系統名 cv. Hedin/2
配列数 3,986 染色体数 2n = 2x = 12
配列長 (bp) 11,914,536,184 N50長 (bp) 1,637,815,978
遺伝子の数 37,065 遺伝子数由来ファイル HEDIN_TMP5.check.renamed.phase.complete_proteins.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio HiFi, linkage map, Hi-C 取得した配列量 20x
アセンブリ方法 hifiasm v0.11-r302, minimap2 v2.20, TRITEX 推定ゲノムサイズ (Mb) 13,000
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Stig U. Andersen (Aarhus University) データソース名 Faba Bean Genome Consortium
論文 (DOIコード) 10.1038/s41586-023-05791-5 データソースURL www.fabagenome.dk
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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