配列名:211010_Vfaba_split_pseudomolecules_hedin_v1pluschlro_clean_unanchored_contigs
ゲノム配列名 | 211010_Vfaba_split_pseudomolecules_hedin_v1pluschlro_clean_unanchored_contigs | 系統名 | cv. Hedin/2 |
配列数 | 3,986 | 染色体数 | 2n = 2x = 12 |
配列長 (bp) | 11,914,536,184 | N50長 (bp) | 1,637,815,978 |
遺伝子の数 | 37,065 | 遺伝子数由来ファイル | HEDIN_TMP5.check.renamed.phase.complete_proteins.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio HiFi, linkage map, Hi-C | 取得した配列量 | 20x |
アセンブリ方法 | hifiasm v0.11-r302, minimap2 v2.20, TRITEX | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 13,000 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Stig U. Andersen (Aarhus University) | データソース名 | Faba Bean Genome Consortium |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41586-023-05791-5 | データソースURL | www.fabagenome.dk |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |