配列名:TSUd_r3.0
ゲノム配列名 | TSUd_r3.0 | 系統名 | cv. Daliak |
配列数 | 13,117 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 531,039,069 | N50長 (bp) | 56,229,069 |
遺伝子の数 | 41,979 | 遺伝子数由来ファイル | TSUd_r3.0.proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 41,979 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Hi-C, Pacbio Sequel, Illumina SLR | 取得した配列量 | 238.2X |
アセンブリ方法 | Velvet, Meraculous, last, Proximo, Linkage map | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 540 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Update TSUd_r1.1 |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | NA | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | データソースURL | https://plantgarden.jp/ | |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.9%[S:94.1%,D:3.8%],F:1.2%,M:0.9%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:92.3%[S:89.2%,D:3.1%],F:3.5%,M:4.2%,n:1614 |