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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Trifolium subterraneum , Sub clover , サブクローバー

Trifolium subterraneum

Genome Assembly ID:t3900.G002

配列名:TSUd_r3.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 TSUd_r3.0 系統名 cv. Daliak
配列数 13,117 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 531,039,069 N50長 (bp) 56,229,069
遺伝子の数 41,979 遺伝子数由来ファイル TSUd_r3.0.proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 41,979 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Hi-C, Pacbio Sequel, Illumina SLR 取得した配列量 238.2X
アセンブリ方法 Velvet, Meraculous, last, Proximo, Linkage map 推定ゲノムサイズ (Mb) 540
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Update TSUd_r1.1
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 NA データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.9%[S:94.1%,D:3.8%],F:1.2%,M:0.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:92.3%[S:89.2%,D:3.1%],F:3.5%,M:4.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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