Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Trifolium subterraneum , Sub clover , サブクローバー

Trifolium subterraneum

Genome Assembly ID:t3900.G001

配列名:TSUd_r1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 TSUd_r1.1 系統名 cv. Daliak
配列数 25,730 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 488,774,188 N50長 (bp) 47,721,588
遺伝子の数 42,706 遺伝子数由来ファイル TSUd_r1.1_pseudomolecule.proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, 454 取得した配列量 552.8x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 2, Newbler v. 2.7, GAM-NGS, SSPACE 推定ゲノムサイズ (Mb) 540
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sachiko N. Isobe (Kazusa DNA Reseach Institute) データソース名 Clover GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1038/srep30358 データソースURL http://clovergarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.7%[S:93.9%,D:3.8%],F:1.5%,M:0.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:79.3%[S:72.8%,D:6.5%],F:11.9%,M:8.8%,n:1614

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット