配列名:TSUd_r1.1
ゲノム配列名 | TSUd_r1.1 | 系統名 | cv. Daliak |
配列数 | 25,730 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 488,774,188 | N50長 (bp) | 47,721,588 |
遺伝子の数 | 42,706 | 遺伝子数由来ファイル | TSUd_r1.1_pseudomolecule.proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, 454 | 取得した配列量 | 552.8x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 2, Newbler v. 2.7, GAM-NGS, SSPACE | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 540 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Sachiko N. Isobe (Kazusa DNA Reseach Institute) | データソース名 | Clover GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1038/srep30358 | データソースURL | http://clovergarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.7%[S:93.9%,D:3.8%],F:1.5%,M:0.8%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:79.3%[S:72.8%,D:6.5%],F:11.9%,M:8.8%,n:1614 |