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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Pisum sativum , garden pea , エンドウ

Pisum sativum

Genome Assembly ID:t3888.G001

配列名:PSA_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 PSA_r1.0 系統名 JI128
配列数 8 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 3,308,835,089 N50長 (bp) 452,090,986
遺伝子の数 531,242 遺伝子数由来ファイル PSA_r1.0.pep.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 531,242 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Nanopore 取得した配列量 44x
アセンブリ方法 WTDBG2 推定ゲノムサイズ (Mb) 4,500
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2020.09.25.313072 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.1%[S:95.8%,D:2.3%],F:0.9%,M:1.0%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:82.7%[S:80.5%,D:2.2%],F:9.0%,M:8.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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