配列名:PSA_r1.0
ゲノム配列名 | PSA_r1.0 | 系統名 | JI128 |
配列数 | 8 | 染色体数 | 2n = 2x = 14 |
配列長 (bp) | 3,308,835,089 | N50長 (bp) | 452,090,986 |
遺伝子の数 | 531,242 | 遺伝子数由来ファイル | PSA_r1.0.pep.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 531,242 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Nanopore | 取得した配列量 | 44x |
アセンブリ方法 | WTDBG2 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 4,500 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1101/2020.09.25.313072 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.1%[S:95.8%,D:2.3%],F:0.9%,M:1.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:82.7%[S:80.5%,D:2.2%],F:9.0%,M:8.3%,n:1614 |