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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Phaseolus vulgaris , Green bean , インゲンマメ

Phaseolus vulgaris

Genome Assembly ID:t3885.G001

配列名:PhaVulg1_0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 PhaVulg1_0 系統名 G19833
配列数 708 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 521,076,696 N50長 (bp) 50,367,376
遺伝子の数 32,720 遺伝子数由来ファイル Phaseolus_vulgaris.PhaVulg1_0.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 32,720 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, 454, ABI3730 取得した配列量 18.6x
アセンブリ方法 ARACHNE v. 20071016_modfied 推定ゲノムサイズ (Mb) 587
シーケンシングの方法のコメント NA コメント An inbred landrace line
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Scott A Jackson (University of Georgia), Jeremy Schmutz (US Department of Energy Joint Genome Institute), Phillip E McClean (North Dakota State University) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1038/ng.3008 データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.7%[S:96.4%,D:2.3%],F:0.6%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.5%[S:82.3%,D:14.2%],F:2.9%,M:0.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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