配列名:PhaVulg1_0
ゲノム配列名 | PhaVulg1_0 | 系統名 | G19833 |
配列数 | 708 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 521,076,696 | N50長 (bp) | 50,367,376 |
遺伝子の数 | 32,720 | 遺伝子数由来ファイル | Phaseolus_vulgaris.PhaVulg1_0.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 32,720 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, 454, ABI3730 | 取得した配列量 | 18.6x |
アセンブリ方法 | ARACHNE v. 20071016_modfied | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 587 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | An inbred landrace line |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Scott A Jackson (University of Georgia), Jeremy Schmutz (US Department of Energy Joint Genome Institute), Phillip E McClean (North Dakota State University) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ng.3008 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.7%[S:96.4%,D:2.3%],F:0.6%,M:0.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.5%[S:82.3%,D:14.2%],F:2.9%,M:0.6%,n:1614 |