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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Medicago truncatula , Medicago truncatula , タルウマゴヤシ

Medicago truncatula

Genome Assembly ID:t3880.G001

配列名:JCVI.Medtr.v4.20130313

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 JCVI.Medtr.v4.20130313 系統名 strain A17
配列数 1,949 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 411,831,487 N50長 (bp) 49,172,423
遺伝子の数 57,585 遺伝子数由来ファイル Mt4.0v2_GenesProteinSeq_20140818_1100.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 57,585 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Sanger, Illumina, 454 取得した配列量 90x
アセンブリ方法 AllPaths v. R40324 推定ゲノムサイズ (Mb) 454
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Christopher D Town (J. Craig Venter Institute) データソース名 Medicago truncatula Genome Database
論文 (DOIコード) 10.1186/1471-2164-15-312 データソースURL http://www.medicagogenome.org/home
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.2%[S:93.3%,D:4.9%],F:0.7%,M:1.1%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.9%[S:76.1%,D:20.8%],F:0.8%,M:2.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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