配列名:JCVI.Medtr.v4.20130313
ゲノム配列名 | JCVI.Medtr.v4.20130313 | 系統名 | strain A17 |
配列数 | 1,949 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 411,831,487 | N50長 (bp) | 49,172,423 |
遺伝子の数 | 57,585 | 遺伝子数由来ファイル | Mt4.0v2_GenesProteinSeq_20140818_1100.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 57,585 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Sanger, Illumina, 454 | 取得した配列量 | 90x |
アセンブリ方法 | AllPaths v. R40324 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 454 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Christopher D Town (J. Craig Venter Institute) | データソース名 | Medicago truncatula Genome Database |
論文 (DOIコード) | 10.1186/1471-2164-15-312 | データソースURL | http://www.medicagogenome.org/home |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.2%[S:93.3%,D:4.9%],F:0.7%,M:1.1%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.9%[S:76.1%,D:20.8%],F:0.8%,M:2.3%,n:1614 |