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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Medicago sativa subsp. sativa , Cultivated alfalfa, Alfalfa, Lucerne (ssp. Sativa) , ムラサキウマゴヤシ (Sativa亜種)

Medicago sativa

Genome Assembly ID:t3879.G002

配列名:ZhongmuNo.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ZhongmuNo.1 系統名 ssp. sativa, cv. Zhongmu No. 1
配列数 657 染色体数 2n = 4x = 32
配列長 (bp) 817,120,364 N50長 (bp) 102,287,719
遺伝子の数 59,827 遺伝子数由来ファイル ZhongmuNo.1.pros.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel, Biona Optical Map, Hi-C 取得した配列量 245.62 Gb (PacBIo), 522 Gb (Bionano), 299 Gb (Hi-C)
アセンブリ方法 MECAT, BioNano Solve, Juicer 推定ゲノムサイズ (Mb) 3,180
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Tao Wang (China Agricultural University) データソース名 Figshare
論文 (DOIコード) 10.1016/j.molp.2020.07.003 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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