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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Medicago sativa , Cultivated alfalfa, Alfalfa, Lucerne , ムラサキウマゴヤシ

Medicago sativa

Genome Assembly ID:t3879.G001

配列名:final_genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 final_genome 系統名 Aohan
配列数 9,821 染色体数 2n = 4x = 32
配列長 (bp) 3,157,508,838 N50長 (bp) 84,274,390
遺伝子の数 164,632 遺伝子数由来ファイル final_gene.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina, Hi-C 取得した配列量 126 Gb(PacBio), 70 Gb(Illumina)
アセンブリ方法 Canu 推定ゲノムサイズ (Mb) 3000(flow cytometry), 3150(k-mer)
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Qiang Qiu (Northwestern Polytechnical University) データソース名 figshare
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-020-16338-x データソースURL https://figshare.com/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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