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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Streptochaeta angustifolia , Streptochaeta angustifolia , Streptochaeta angustifolia

Streptochaeta angustifolia

Genome Assembly ID:t38733.G001

配列名:Streptochaeta_BioNanoRedundans_scaffolds_V1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Streptochaeta_BioNanoRedundans_scaffolds_V1 系統名 NA
配列数 17,040 染色体数 NA
配列長 (bp) 1,797,859,444 N50長 (bp) 2,643,565
遺伝子の数 45,006 遺伝子数由来ファイル Streptochaeta_BIND_predictions_V1-pep-primary.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, Bionano optical map 取得した配列量 25.7x(paired-end), 22.6x(mate-pair)
アセンブリ方法 MaSuRCA v2.21 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,770
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Matthew B. Hufford (Iowa State University) データソース名 Data Commons
論文 (DOIコード) 10.3389/fpls.2021.710383 データソースURL https://datacommons.cyverse.org
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.3%[S:92.4%,D:5.0%],F:2.0%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:85.1%[S:81.0%,D:4.0%],F:9.7%,M:5.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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