配列名:Streptochaeta_BioNanoRedundans_scaffolds_V1
ゲノム配列名 | Streptochaeta_BioNanoRedundans_scaffolds_V1 | 系統名 | NA |
配列数 | 17,040 | 染色体数 | NA |
配列長 (bp) | 1,797,859,444 | N50長 (bp) | 2,643,565 |
遺伝子の数 | 45,006 | 遺伝子数由来ファイル | Streptochaeta_BIND_predictions_V1-pep-primary.fa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, Bionano optical map | 取得した配列量 | 25.7x(paired-end), 22.6x(mate-pair) |
アセンブリ方法 | MaSuRCA v2.21 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,770 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Matthew B. Hufford (Iowa State University) | データソース名 | Data Commons |
論文 (DOIコード) | 10.3389/fpls.2021.710383 | データソースURL | https://datacommons.cyverse.org |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |