配列名:P.virgatum_v5
ゲノム配列名 | P.virgatum_v5 | 系統名 | AP13 |
配列数 | 627 | 染色体数 | 2n=4x=36,2n=6x=54,2n=8x=72 |
配列長 (bp) | 1,129,997,604 | N50長 (bp) | 64,346,616 |
遺伝子の数 | 84,836 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_016808335.1_P.virgatum_v5_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PACBIO | 取得した配列量 | 177.12x(Illumina), 83.42x(PacBio) |
アセンブリ方法 | MECAT | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,200 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | John T.Lovell(Jerry Jenkins Genome Sequencing Center), Thomas E.Juenger(University of Texas at Austin), Jeremy Schmutz(Genome Sequencing Center, HudsonAlpha Institute for Biotechnology; Department of Energy Joint Genome Institute, Lawrence Berkeley National Laboratory) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41586-020-03127-1 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.3%[S:13.3%,D:86.0%],F:0.4%,M:0.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.8%[S:8.7%,D:91.1%],F:0.1%,M:0.1%,n:1614 |