配列名:LupAngTanjil_v1.0
ゲノム配列名 | LupAngTanjil_v1.0 | 系統名 | cv. Tanjil |
配列数 | 13,573 | 染色体数 | 2n = 2x = 40 |
配列長 (bp) | 609,203,021 | N50長 (bp) | 21,299,880 |
遺伝子の数 | 33,083 | 遺伝子数由来ファイル | Lupinus_angustifolius.LupAngTanjil_v1.0.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 33,083 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 162.8x |
アセンブリ方法 | CutAdapt v. 1.1; FLASH v. 1.2.2; Kmerfreq v. 2015-05-28; SOAPdenovo2 v. 2015-05-28; SSPACE2 v. 2.0; BGI GapCloser v. 2015-05-28 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 951 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Karam B. Singh (Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation Agriculture) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1111/pbi.12615 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.8%[S:84.1%,D:14.7%],F:0.2%,M:1.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:93.1%[S:79.7%,D:13.4%],F:3.4%,M:3.5%,n:1614 |