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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Lupinus angustifolius , Blue lupine , カサバルピナス

Lupinus angustifolius

Genome Assembly ID:t3871.G001

配列名:LupAngTanjil_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 LupAngTanjil_v1.0 系統名 cv. Tanjil
配列数 13,573 染色体数 2n = 2x = 40
配列長 (bp) 609,203,021 N50長 (bp) 21,299,880
遺伝子の数 33,083 遺伝子数由来ファイル Lupinus_angustifolius.LupAngTanjil_v1.0.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 33,083 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 162.8x
アセンブリ方法 CutAdapt v. 1.1; FLASH v. 1.2.2; Kmerfreq v. 2015-05-28; SOAPdenovo2 v. 2015-05-28; SSPACE2 v. 2.0; BGI GapCloser v. 2015-05-28 推定ゲノムサイズ (Mb) 951
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Karam B. Singh (Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation Agriculture) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1111/pbi.12615 データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.8%[S:84.1%,D:14.7%],F:0.2%,M:1.0%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:93.1%[S:79.7%,D:13.4%],F:3.4%,M:3.5%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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