配列名:La_Amiga3.1
ゲノム配列名 | La_Amiga3.1 | 系統名 | cv. Amiga, isolate GWH2020 |
配列数 | 1,580 | 染色体数 | 2n = 2x = 50 |
配列長 (bp) | 558,898,008 | N50長 (bp) | 18,661,206 |
遺伝子の数 | 48,719 | 遺伝子数由来ファイル | Lalbus_gene_pep_V1.0.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 48,719 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBIO | 取得した配列量 | 140.0x |
アセンブリ方法 | Canu v. 1.8 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 450 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | GenBank: JAAEJY000000000.1, Related ssembly Name: La_Amiga3.1 |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Weifeng Xu (Fujian Agriculture and Forestry University), Qian Zhang (ditto), Tianyu Xia (ditto), Feng Cheng (Chinese Academy of Agricultural Sciences) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-020-14891-z | データソースURL | https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA/010/261/695/GCA_010261695.1_La_Amiga3.1/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.8%[S:86.2%,D:12.6%],F:0.4%,M:0.8%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:94.5%[S:82.8%,D:11.7%],F:0.9%,M:4.6%,n:1614 |