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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Lupinus albus , White lupin , シロバナルピナス, シロバナハウチワマメ

Lupinus albus

Genome Assembly ID:t3870.G002

配列名:La_Amiga3.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 La_Amiga3.1 系統名 cv. Amiga, isolate GWH2020
配列数 1,580 染色体数 2n = 2x = 50
配列長 (bp) 558,898,008 N50長 (bp) 18,661,206
遺伝子の数 48,719 遺伝子数由来ファイル Lalbus_gene_pep_V1.0.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 48,719 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBIO 取得した配列量 140.0x
アセンブリ方法 Canu v. 1.8 推定ゲノムサイズ (Mb) 450
シーケンシングの方法のコメント NA コメント GenBank: JAAEJY000000000.1, Related ssembly Name: La_Amiga3.1
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Weifeng Xu (Fujian Agriculture and Forestry University), Qian Zhang (ditto), Tianyu Xia (ditto), Feng Cheng (Chinese Academy of Agricultural Sciences) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-020-14891-z データソースURL https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA/010/261/695/GCA_010261695.1_La_Amiga3.1/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.8%[S:86.2%,D:12.6%],F:0.4%,M:0.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:94.5%[S:82.8%,D:11.7%],F:0.9%,M:4.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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