配列名:Lupin genome version 1.0
ゲノム配列名 | Lupin genome version 1.0 | 系統名 | cv. Amiga |
配列数 | 89 | 染色体数 | 2n = 2x = 50 |
配列長 (bp) | 450,972,408 | N50長 (bp) | 17,349,171 |
遺伝子の数 | 38,258 | 遺伝子数由来ファイル | prot.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 38,258 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio, BioNano | 取得した配列量 | 372.0x |
アセンブリ方法 | CANU v. 1.6; FALCON v. 0.7.3; Bionano-Solve v. 3.1; allmaps v. NOVEMBER-2017 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 450 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Benjamin Peret (Montpellier SupAgro) | データソース名 | White Lupin Genome |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-019-14197-9 | データソースURL | https://www.whitelupin.fr/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.5%[S:86.2%,D:12.3%],F:0.5%,M:1.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.3%[S:84.3%,D:12.0%],F:2.7%,M:1.0%,n:1614 |