Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Lupinus albus , White lupin , シロバナルピナス, シロバナハウチワマメ

Lupinus albus

Genome Assembly ID:t3870.G001

配列名:Lupin genome version 1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Lupin genome version 1.0 系統名 cv. Amiga
配列数 89 染色体数 2n = 2x = 50
配列長 (bp) 450,972,408 N50長 (bp) 17,349,171
遺伝子の数 38,258 遺伝子数由来ファイル prot.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 38,258 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, BioNano 取得した配列量 372.0x
アセンブリ方法 CANU v. 1.6; FALCON v. 0.7.3; Bionano-Solve v. 3.1; allmaps v. NOVEMBER-2017 推定ゲノムサイズ (Mb) 450
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Benjamin Peret (Montpellier SupAgro) データソース名 White Lupin Genome
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-019-14197-9 データソースURL https://www.whitelupin.fr/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.5%[S:86.2%,D:12.3%],F:0.5%,M:1.0%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.3%[S:84.3%,D:12.0%],F:2.7%,M:1.0%,n:1614

遺伝子をさがす

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット