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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Lathyrus sativus , Grass pea , Lathyrus sativus

Lathyrus sativus

Genome Assembly ID:t3860.G002

配列名:Rbp_9 largest HiC scaffolds

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Rbp_9 largest HiC scaffolds 系統名 LS007
配列数 162,994 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 6,237,246,683 N50長 (bp) 157,998
遺伝子の数 95,221 遺伝子数由来ファイル LATSA3860_EIv1.0.annotation.gff3.pep.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore, Illumina, Hi-C 取得した配列量 34.6x (ONT), 49.7x (Illumina)
アセンブリ方法 Redbean, 3D-DNA 201008-cb63403 推定ゲノムサイズ (Mb) 6,517
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Peter M. F. Emmrich (John Innes Centre) データソース名 zenodo
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-023-36503-2 データソースURL https://zenodo.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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