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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Lathyrus sativus , Grass pea , Lathyrus sativus

Lathyrus sativus

Genome Assembly ID:t3860.G001

配列名:Lathyrus_scaffolded_1kb

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Lathyrus_scaffolded_1kb 系統名 Pusa-24
配列数 7 染色体数 n = 7
配列長 (bp) 3,824,492,884 N50長 (bp) 755,273,189
遺伝子の数 50,106 遺伝子数由来ファイル Lathyrus_final_proteins.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio 取得した配列量 625_Gb(Illumina), 85 Gb(PacBio)
アセンブリ方法 MaSuRCA assembler v4.0.3 推定ゲノムサイズ (Mb) 6,620
シーケンシングの方法のコメント A total of three paired-end (300_bp, 500_bp, and 800_bp insert size), and 3 mate-pair (2_5 Kb, 5_8 Kb, and 8_10 Kb insert size) libraries were generated. コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Pramod Kaitheri Kandoth (Central University of Kerala) データソース名 Zendo
論文 (DOIコード) 10.1038/s41597-022-01903-4 データソースURL https://zenodo.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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