配列名:Lathyrus_scaffolded_1kb
ゲノム配列名 | Lathyrus_scaffolded_1kb | 系統名 | Pusa-24 |
配列数 | 7 | 染色体数 | n = 7 |
配列長 (bp) | 3,824,492,884 | N50長 (bp) | 755,273,189 |
遺伝子の数 | 50,106 | 遺伝子数由来ファイル | Lathyrus_final_proteins.fasta.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio | 取得した配列量 | 625_Gb(Illumina), 85 Gb(PacBio) |
アセンブリ方法 | MaSuRCA assembler v4.0.3 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 6,620 |
シーケンシングの方法のコメント | A total of three paired-end (300_bp, 500_bp, and 800_bp insert size), and 3 mate-pair (2_5 Kb, 5_8 Kb, and 8_10 Kb insert size) libraries were generated. | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Pramod Kaitheri Kandoth (Central University of Kerala) | データソース名 | Zendo |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41597-022-01903-4 | データソースURL | https://zenodo.org |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |