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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Camellia oleifera var. Nanyongensis , Tea-oil camellia (var. Nanyongensis) , オキナワサザンカ, ユチャ (Nanyongensis変種)

Camellia oleifera

Genome Assembly ID:t385388.G001

配列名:CON_genome_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 CON_genome_v1.0 系統名 var. Nanyongensis (CON)
配列数 2,143 染色体数 2n = 2x = 30
配列長 (bp) 2,891,061,056 N50長 (bp) 185,364,083
遺伝子の数 46,612 遺伝子数由来ファイル Chrall.proteins.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Falcon (v0.3.0) 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,950
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Hengfu Yin (Chinese Academy of Forestry) データソース名 Zenodo
論文 (DOIコード) 10.1186/s13059-021-02599-2 データソースURL https://zenodo.org/record/5768785
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:94.8%[S:68.0%,D:26.8%],F:1.7%,M:3.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:50.9%[S:31.0%,D:20.0%],F:6.1%,M:42.9%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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