Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Camellia oleifera var. Nanyongensis , Tea-oil camellia (var. Nanyongensis) , オキナワサザンカ, ユチャ (Nanyongensis変種)

Camellia oleifera

Genome Assembly ID:t385388.G001

配列名:CON_genome_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 CON_genome_v1.0 系統名 var. Nanyongensis (CON)
配列数 2,143 染色体数 2n = 2x = 30
配列長 (bp) 2,891,061,056 N50長 (bp) 185,364,083
遺伝子の数 46,612 遺伝子数由来ファイル Chrall.proteins.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Falcon (v0.3.0) 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,950
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Hengfu Yin (Chinese Academy of Forestry) データソース名 Zenodo
論文 (DOIコード) 10.1186/s13059-021-02599-2 データソースURL https://zenodo.org/record/5768785
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット