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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Glycine soja , Wild soybean (soja) , ダイズ野生種 (soja種), ツルマメ

Glycine soja

Genome Assembly ID:t3848.G002

配列名:PI483463.gnm1.YJWS

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 PI483463.gnm1.YJWS 系統名 PI483463
配列数 306 染色体数 2n = 2x = 40
配列長 (bp) 985,259,765 N50長 (bp) 48,820,172
遺伝子の数 62,102 遺伝子数由来ファイル glyso.PI483463.gnm1.ann1.3Q3Q.protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 250x
アセンブリ方法 DeNovoMAGIC v. 2016-08 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,000
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Henry T. Nguyen (University of Missouri) データソース名 SoyBase
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.14500 データソースURL https://www.soybase.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.5%[S:43.1%,D:56.4%],F:0.2%,M:0.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:98.7%[S:32.3%,D:66.4%],F:0.7%,M:0.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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