配列名:W05.gnm1.SVL1
ゲノム配列名 | W05.gnm1.SVL1 | 系統名 | W05 |
配列数 | 1,118 | 染色体数 | 2n = 2x = 40 |
配列長 (bp) | 1,013,211,804 | N50長 (bp) | 50,696,784 |
遺伝子の数 | 89,477 | 遺伝子数由来ファイル | glyso.W05.gnm1.ann1.T47J.protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 89,477 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio | 取得した配列量 | 77x |
アセンブリ方法 | MECAT v. Aug-2017 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,000 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Ting-Fung Chan (Chinese University of Hong Kong), Hon-Ming Lam (ditto) | データソース名 | SoyBase |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-019-09142-9 | データソースURL | https://www.soybase.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.6%[S:42.3%,D:57.3%],F:0.2%,M:0.2%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:98.7%[S:25.8%,D:72.9%],F:1.1%,M:0.2%,n:1614 |