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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Glycine max , Soybean , ダイズ

Glycine max

Genome Assembly ID:t3847.G003

配列名:Gmax_ZH13

ゲノム配列の詳細

配列名 Gmax_ZH13 系統名 cv. Zhonghuang 13
配列数 570 染色体数 2n = 2x = 40
配列長 (bp) 1,020,296,243 N50長 (bp) 51,865,536
遺伝子の数 58,017 遺伝子数由来ファイル GWHAAEV00000000.Protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 57,980 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio 取得した配列量 250x
アセンブリ方法 HGAP v. 2017-05, Bionano optical map v. 2017-05 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,100
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文 (DOIコード) 10.1007/s11427-018-9360-0 責任著者 Zhixi Tian (Chinese Academy of Sciences), Shisong Ma (University of Science and Technology of China), Jianchang Du (Jiangsu Academy of Agricultural Sciences)
データソース名 Genome Warehouse データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.4%[S:42.6%,D:56.8%],F:0.3%,M:0.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:98.8%[S:40.1%,D:58.7%],F:0.9%,M:0.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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