配列名:Gmax_ZH13
ゲノム配列名 | Gmax_ZH13 | 系統名 | cv. Zhonghuang 13 |
配列数 | 570 | 染色体数 | 2n = 2x = 40 |
配列長 (bp) | 1,020,296,243 | N50長 (bp) | 51,865,536 |
遺伝子の数 | 58,017 | 遺伝子数由来ファイル | GWHAAEV00000000.Protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 58,017 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio | 取得した配列量 | 250x |
アセンブリ方法 | HGAP v. 2017-05, Bionano optical map v. 2017-05 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,100 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Zhixi Tian (Chinese Academy of Sciences), Shisong Ma (University of Science and Technology of China), Jianchang Du (Jiangsu Academy of Agricultural Sciences) | データソース名 | Genome Warehouse |
論文 (DOIコード) | 10.1007/s11427-018-9360-0 | データソースURL | https://bigd.big.ac.cn/gwh/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.4%[S:42.6%,D:56.8%],F:0.3%,M:0.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:98.8%[S:40.1%,D:58.7%],F:0.9%,M:0.3%,n:1614 |