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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Glycine max , Soybean , ダイズ

Glycine max

Genome Assembly ID:t3847.G002

配列名:Lee.gnm1

ゲノム配列の詳細

配列名 Lee.gnm1 系統名 cv. Lee
配列数 292 染色体数 2n = 2x = 40
配列長 (bp) 1,016,275,704 N50長 (bp) 50,397,291
遺伝子の数 71,358 遺伝子数由来ファイル glyma.Lee.gnm1.ann1.6NZV.protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 71,358 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio 取得した配列量 290x
アセンブリ方法 PacBio Falcon v. 2016-06, BioNano optical map v. 2016-07, DeNovoMAGIC v. 2016-08 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,100
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.14500 責任著者 Henry T. Nguyen (University of Missouri)
データソース名 SoyBase データソースURL https://www.soybase.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.5%[S:43.0%,D:56.5%],F:0.2%,M:0.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.4%[S:30.4%,D:69.0%],F:0.6%,M:0.0%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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