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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Eragrostis curvula , Weeping lovegrass , シナダレスズメガヤ

Eragrostis curvula

Genome Assembly ID:t38414.G001

配列名:CERZOS_E.curvula1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 CERZOS_E.curvula1.0 系統名 cv. Victoria
配列数 1,143 染色体数 2n = 2x = 20
配列長 (bp) 603,072,269 N50長 (bp) 43,444,889
遺伝子の数 55,182 遺伝子数由来ファイル GCA_007726485.1_CERZOS_E.curvula1.0_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 55,182 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Sequel, Chicago, Hi-C 取得した配列量 90.0x
アセンブリ方法 FALCON v. May-2016 推定ゲノムサイズ (Mb) 660
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 M. Caccamo (National Institute of Agricultural Botany), V. echenique(Universidad Nacional del Sur) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41598-019-46610-0 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.2%[S:75.8%,D:22.4%],F:0.8%,M:1.0%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:91.1%[S:64.5%,D:26.6%],F:2.7%,M:6.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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