配列名:Carietinum_492_v1.0
ゲノム配列名 | Carietinum_492_v1.0 | 系統名 | cv. CDC Frontier |
配列数 | 7,163 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 532,289,632 | N50長 (bp) | 39,989,001 |
遺伝子の数 | 28,269 | 遺伝子数由来ファイル | Carietinum_492_v1.0.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 28,269 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 120x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 2.03 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 738 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | A kabuli-type chickpea |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Rajeev K Varshney (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics), Jun Wang (Beijing Genomics Institute (BGI)), Douglas R Cook (University of California) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nbt.2491 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.4%[S:97.4%,D:2.0%],F:0.2%,M:0.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:90.8%[S:88.9%,D:1.9%],F:5.1%,M:4.1%,n:1614 |