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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cicer arietinum , Chickpea , ヒヨコマメ

Cicer arietinum

Genome Assembly ID:t3827.G001

配列名:Carietinum_492_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Carietinum_492_v1.0 系統名 cv. CDC Frontier
配列数 7,163 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 532,289,632 N50長 (bp) 39,989,001
遺伝子の数 28,269 遺伝子数由来ファイル Carietinum_492_v1.0.protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 28,269 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 120x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 2.03 推定ゲノムサイズ (Mb) 738
シーケンシングの方法のコメント NA コメント A kabuli-type chickpea
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Rajeev K Varshney (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics), Jun Wang (Beijing Genomics Institute (BGI)), Douglas R Cook (University of California) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1038/nbt.2491 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.4%[S:97.4%,D:2.0%],F:0.2%,M:0.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:90.8%[S:88.9%,D:1.9%],F:5.1%,M:4.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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