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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cajanus cajan , Pigeon pea , キマメ

Cajanus cajan

Genome Assembly ID:t3821.G001

配列名:ICPL87119.gnm1.SBGP

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ICPL87119.gnm1.SBGP 系統名 cv. Asha
配列数 137,542 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 605,780,537 N50長 (bp) 516,056
遺伝子の数 48,680 遺伝子数由来ファイル cajca.ICPL87119.gnm1.ann1.Y27M.protein_main.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 48,680 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 160x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 1.05 推定ゲノムサイズ (Mb) 833
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Asha, ICPL 87119
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Rajeev K Varshney (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics) データソース名 LIS: Legume Information System
論文 (DOIコード) 10.1038/nbt.2022 データソースURL https://legumeinfo.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.9%[S:95.2%,D:2.7%],F:1.0%,M:1.1%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:90.4%[S:86.8%,D:3.6%],F:5.2%,M:4.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット