配列名:ICPL87119.gnm1.SBGP
ゲノム配列名 | ICPL87119.gnm1.SBGP | 系統名 | cv. Asha |
配列数 | 137,542 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 605,780,537 | N50長 (bp) | 516,056 |
遺伝子の数 | 48,680 | 遺伝子数由来ファイル | cajca.ICPL87119.gnm1.ann1.Y27M.protein_main.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 48,680 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 160x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 1.05 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 833 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Asha, ICPL 87119 |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Rajeev K Varshney (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics) | データソース名 | LIS: Legume Information System |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nbt.2022 | データソースURL | https://legumeinfo.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.9%[S:95.2%,D:2.7%],F:1.0%,M:1.1%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:90.4%[S:86.8%,D:3.6%],F:5.2%,M:4.4%,n:1614 |