配列名:PPY_r1.0
ゲノム配列名 | PPY_r1.0 | 系統名 | cv. Nijisseiki |
配列数 | 42 | 染色体数 | 2n = 2x = 34 |
配列長 (bp) | 503,895,333 | N50長 (bp) | 29,571,100 |
遺伝子の数 | 44,876 | 遺伝子数由来ファイル | PPY_r1.0.pep.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 44,876 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio | 取得した配列量 | 136x |
アセンブリ方法 | Falcon_Unzip | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 537 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1101/2020.12.17.423204 | データソースURL | https://plantgarden.jp |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.4%[S:60.2%,D:38.2%],F:0.9%,M:0.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.7%[S:60.3%,D:36.4%],F:1.7%,M:1.6%,n:1614 |