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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Pyrus pyrifolia , Japanese pear, Chinese sand pear , ニホンナシ, ヤマナシ, ニホンヤマナシ

Pyrus pyrifolia

Genome Assembly ID:t3767.G001

配列名:PPY_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 PPY_r1.0 系統名 cv. Nijisseiki
配列数 42 染色体数 2n = 2x = 34
配列長 (bp) 503,895,333 N50長 (bp) 29,571,100
遺伝子の数 44,876 遺伝子数由来ファイル PPY_r1.0.pep.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 44,876 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 136x
アセンブリ方法 Falcon_Unzip 推定ゲノムサイズ (Mb) 537
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2020.12.17.423204 データソースURL https://plantgarden.jp
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.4%[S:60.2%,D:38.2%],F:0.9%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.7%[S:60.3%,D:36.4%],F:1.7%,M:1.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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