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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Silene latifolia , White campion , マツヨイセンノウ

Silene latifolia

Genome Assembly ID:t37657.G001

配列名:GWHCBIJ00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHCBIJ00000000 系統名 female
配列数 4,625 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 2,638,611,122 N50長 (bp) 193,566,110
遺伝子の数 37,796 遺伝子数由来ファイル GWHCBIJ00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel IIe, Hi-C 取得した配列量 104.9 Gb (PacBio), 134.8 Gb (Hi-C)
アセンブリ方法 Hifiasm, ALLHiC v0.9.13, Chromap v0.2.4, 3D-DNA v180922 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Dmitry A. Filatov (University of Oxford) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1016/j.cub.2023.05.046 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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