配列名:Prunus_persica_ChineseCling_v1.0
ゲノム配列名 | Prunus_persica_ChineseCling_v1.0 | 系統名 | cv. Chinese Cling |
配列数 | 135 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 247,344,224 | N50長 (bp) | 29,684,974 |
遺伝子の数 | 26,335 | 遺伝子数由来ファイル | Ppersica-chinesecling.protein.fa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel, Hi-C | 取得した配列量 | 176x (PacBio), 121x (Hi-C) |
アセンブリ方法 | SMARTdenovo, WTDBG2, CANU, bowtie2, LACHESIS | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 250 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Lirong Wang (Chinese Academy of Agricultural Sciences) | データソース名 | GDR: Genome Database For Rosaceae |
論文 (DOIコード) | 10.1111/tpj.15439 | データソースURL | https://www.rosaceae.org/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |