配列名:Prunus_persica_NCBIv2
ゲノム配列名 | Prunus_persica_NCBIv2 | 系統名 | cv. Lovell |
配列数 | 191 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 227,411,381 | N50長 (bp) | 27,368,013 |
遺伝子の数 | 47,089 | 遺伝子数由来ファイル | Prunus_persica.Prunus_persica_NCBIv2.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 47,089 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | ABI 3739 | 取得した配列量 | 8.47x |
アセンブリ方法 | ARACHNE v. 20071016_modified | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 269 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | The International Peach Genome Initiative, Ignazio Verde (Centro di Ricerca per la Frutticoltura), Albert G Abbott (Clemson University), Michele Morgante (Istituto di Genomica Applicata), Daniel S Rokhsar (US Department of Energy Joint Genome Institute) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ng.2586 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.8%[S:97.1%,D:1.7%],F:0.8%,M:0.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.2%[S:56.1%,D:43.1%],F:0.2%,M:0.6%,n:1614 |