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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Prunus persica , Peach, Nectarine, Flat peach , モモ, ネクタリン

Prunus persica

Genome Assembly ID:t3760.G001

配列名:Prunus_persica_NCBIv2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Prunus_persica_NCBIv2 系統名 cv. Lovell
配列数 191 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 227,411,381 N50長 (bp) 27,368,013
遺伝子の数 47,089 遺伝子数由来ファイル Prunus_persica.Prunus_persica_NCBIv2.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 47,089 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 ABI 3739 取得した配列量 8.47x
アセンブリ方法 ARACHNE v. 20071016_modified 推定ゲノムサイズ (Mb) 269
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 The International Peach Genome Initiative, Ignazio Verde (Centro di Ricerca per la Frutticoltura), Albert G Abbott (Clemson University), Michele Morgante (Istituto di Genomica Applicata), Daniel S Rokhsar (US Department of Energy Joint Genome Institute) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1038/ng.2586 データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.8%[S:97.1%,D:1.7%],F:0.8%,M:0.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.2%[S:56.1%,D:43.1%],F:0.2%,M:0.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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