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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cerasus x yedoensis var. nudiflora , Somei-Yoshino, Yoshino cherry (nudiflora) , ソメイヨシノ(nudiflora変種)

Cerasus x yedoensis

Genome Assembly ID:t3759.G002

配列名:Pyn_1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Pyn_1.0 系統名 var. nudiflora, Korea National Monument No. 159, Pyn-Jeju2
配列数 4,016 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 319,209,792 N50長 (bp) 145,140
遺伝子の数 41,294 遺伝子数由来ファイル GCA_002966975.2_Pyn_1.0_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RSII 取得した配列量 73x
アセンブリ方法 FALCON v0.3.0, SOAPdenovo2.04 推定ゲノムサイズ (Mb) 284
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Synonym: Prunus yedoensis, Cerasus x yedoensis
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jeong-Hwan Mun (Myongji University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1186/s13059-018-1497-y データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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