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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cerasus x yedoensis , Somei-Yoshino , ソメイヨシノ

Cerasus x yedoensis

Genome Assembly ID:t3759.G001

配列名:CYE_r3.1.pmol

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 CYE_r3.1.pmol 系統名 Somei-Yoshino
配列数 18 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 735,635,700 N50長 (bp) 735,635,700
遺伝子の数 95,076 遺伝子数由来ファイル CYE_r3.1.proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 95,076 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 54x
アセンブリ方法 Falcon 推定ゲノムサイズ (Mb) 690
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsz016 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.2%[S:12.3%,D:86.9%],F:0.5%,M:0.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.1%[S:12.8%,D:83.3%],F:0.6%,M:3.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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