配列名:CYE_r3.1.pmol
ゲノム配列名 | CYE_r3.1.pmol | 系統名 | Somei-Yoshino |
配列数 | 18 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 735,635,700 | N50長 (bp) | 735,635,700 |
遺伝子の数 | 95,076 | 遺伝子数由来ファイル | CYE_r3.1.proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 95,076 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio | 取得した配列量 | 54x |
アセンブリ方法 | Falcon | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 690 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsz016 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.2%[S:12.3%,D:86.9%],F:0.5%,M:0.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.1%[S:12.8%,D:83.3%],F:0.6%,M:3.3%,n:1614 |