配列名:P.domestica_v1.0.
ゲノム配列名 | P.domestica_v1.0. | 系統名 | cv. Improved French |
配列数 | 2,747 | 染色体数 | 2n = 6x = 48 |
配列長 (bp) | 1,313,107,328 | N50長 (bp) | 1,738,059 |
遺伝子の数 | 138,361 | 遺伝子数由来ファイル | P.domestica_Genome-Dardick_v1.0.proteins.faa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | NRGene, Illumina, 10x Genomics | 取得した配列量 | 210x |
アセンブリ方法 | DeNovoMAGICv3.0 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | combination of NRGene and Illumina, Chromium 10x libraries | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Christopher D. Dardick (USDA-ARS) | データソース名 | GDR: Genome Database For Rosaceae |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41438-020-00438-2 | データソースURL | https://www.rosaceae.org/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |