配列名:pdulcis_v2.0
ゲノム配列名 | pdulcis_v2.0 | 系統名 | cv. Texas |
配列数 | 691 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 227,599,157 | N50長 (bp) | 24,375,383 |
遺伝子の数 | 31,654 | 遺伝子数由来ファイル | Prudul26A.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 31,654 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | NA | 取得した配列量 | 800x |
アセンブリ方法 | MaSuRCA (v3.2.3) | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 240 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Pere Arus(Centre for Research in Agricultural Genomics), Josep M. Casacuberta (Institute for Research and Technology in Food and Agriculture) | データソース名 | GDR: Genome Database For Rosaceae |
論文 (DOIコード) | 10.1111/tpj.14538 | データソースURL | https://www.rosaceae.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.4%[S:95.0%,D:2.4%],F:0.6%,M:2.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.6%[S:74.7%,D:20.9%],F:0.4%,M:4.0%,n:1614 |