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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Prunus dulcis , Almond , アーモンド, ヘントウ

Prunus dulcis

Genome Assembly ID:t3755.G001

配列名:pdulcis_v2.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 pdulcis_v2.0 系統名 cv. Texas
配列数 691 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 227,599,157 N50長 (bp) 24,375,383
遺伝子の数 31,654 遺伝子数由来ファイル Prudul26A.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 31,654 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 NA 取得した配列量 800x
アセンブリ方法 MaSuRCA (v3.2.3) 推定ゲノムサイズ (Mb) 240
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Pere Arus(Centre for Research in Agricultural Genomics), Josep M. Casacuberta (Institute for Research and Technology in Food and Agriculture) データソース名 GDR: Genome Database For Rosaceae
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.14538 データソースURL https://www.rosaceae.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.4%[S:95.0%,D:2.4%],F:0.6%,M:2.0%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:95.6%[S:74.7%,D:20.9%],F:0.4%,M:4.0%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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