配列名:Malus_x_domestica_Honeycrisp_HAP2_v1.1.a1
ゲノム配列名 | Malus_x_domestica_Honeycrisp_HAP2_v1.1.a1 | 系統名 | cv. Honeycrisp |
配列数 | 193 | 染色体数 | 2n = 2x = 34 |
配列長 (bp) | 660,238,068 | N50長 (bp) | 37,851,121 |
遺伝子の数 | 51,995 | 遺伝子数由来ファイル | g.Honeycrisp_HAP2_braker1+2_combined_fullSupport_longname_filtered.pep.fa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel II | 取得した配列量 | 55x |
アセンブリ方法 | hifiasm v0.16.1, Juicer pipeline v1.6 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Loren Honaas (USDA ARS Tree Fruit Research Lab) | データソース名 | GIGA DB |
論文 (DOIコード) | 10.46471/gigabyte.69 | データソースURL | http://gigadb.org/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |