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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Malus x domestica , Apple , リンゴ, セイヨウリンゴ

Malus x domestica

Genome Assembly ID:t3750.G006

配列名:Malus_x_domestica_Honeycrisp_HAP2_v1.1.a1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Malus_x_domestica_Honeycrisp_HAP2_v1.1.a1 系統名 cv. Honeycrisp
配列数 193 染色体数 2n = 2x = 34
配列長 (bp) 660,238,068 N50長 (bp) 37,851,121
遺伝子の数 51,995 遺伝子数由来ファイル g.Honeycrisp_HAP2_braker1+2_combined_fullSupport_longname_filtered.pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II 取得した配列量 55x
アセンブリ方法 hifiasm v0.16.1, Juicer pipeline v1.6 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Loren Honaas (USDA ARS Tree Fruit Research Lab) データソース名 GIGA DB
論文 (DOIコード) 10.46471/gigabyte.69 データソースURL http://gigadb.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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