配列名:Malus_x_domestica_HFTH1_v1.0.a1
ゲノム配列名 | Malus_x_domestica_HFTH1_v1.0.a1 | 系統名 | HFTH1 |
配列数 | 18 | 染色体数 | 2n = 2x = 34 |
配列長 (bp) | 660,495,220 | N50長 (bp) | 37,138,690 |
遺伝子の数 | 44,677 | 遺伝子数由来ファイル | HFTH1.gene.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 44,677 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio | 取得した配列量 | 100x |
アセンブリ方法 | FALCON v. 0.4 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 750 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | An anther-derived trihaploid Hanfu line. Hanfu (Dongguang x Fuji) is a very influential cultivar in China. |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Depeng Wang (Nextomics Biosciences Institute), Peihua Cong(Chinese Academy of Agricultural Science) | データソース名 | GDR: Genome Database For Rosaceae |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-019-09518-x | データソースURL | https://www.rosaceae.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.7%[S:62.1%,D:36.6%],F:0.7%,M:0.6%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:94.9%[S:64.0%,D:30.9%],F:1.2%,M:3.9%,n:1614 |