配列名:Mdomestica_491_GDDH13v1.1
ゲノム配列名 | Mdomestica_491_GDDH13v1.1 | 系統名 | GDDH13 |
配列数 | 18 | 染色体数 | 2n = 2x = 34 |
配列長 (bp) | 709,561,391 | N50長 (bp) | 37,604,908 |
遺伝子の数 | 45,116 | 遺伝子数由来ファイル | Mdomestica_491_v1.1.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 45,116 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio, BioNano | 取得した配列量 | 700x |
アセンブリ方法 | DBG2OLC v. 2016-05, SOAPdenovo2 v. 2016-05, BESST v. 2016-05, BioNano hybrid assembly v. 2016-05 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 750 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | A dihaploid 'Golden Delicious' derivative |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Riccardo Velasco (Foundation Edmund Mach) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ng.654 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.9%[S:62.3%,D:35.6%],F:0.8%,M:1.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.7%[S:65.2%,D:31.5%],F:1.4%,M:1.9%,n:1614 |