アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Strawberry , イチゴ, オランダイチゴ

Fragaria x ananassa

Genome Assembly ID:t3747.G002

配列名:Fragaria x ananassa Camarosa genome assembly v1.0

ゲノム配列の詳細

配列名 Fragaria x ananassa Camarosa genome assembly v1.0 系統名 cv. Camarosa
配列数 28 染色体数 2n=56
配列長 (bp) 805,488,706 N50長 (bp) 27,809,139
遺伝子の数 108,087 遺伝子数由来ファイル Fxa_v1.2_makerStandard_proteins_woTposases.fasta
シーケンシングの方法 Illumina, 10X Genomics, PacBio 取得した配列量 615x
アセンブリ方法 DenovoMAGIC3, HiRise pipeline, PBJelly 推定ゲノムサイズ (Mb) 813
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文 (DOIコード) 10.1038/s41588-019-0356-4 責任著者 Patrick P. Edger (Michigan State University), Steven J. Knapp (University of California_Davis)
データソース名 GDR: Genome Database For Rosaceae データソースURL https://www.rosaceae.org/

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