配列名:Fragaria x ananassa Camarosa genome assembly v1.0
ゲノム配列名 | Fragaria x ananassa Camarosa genome assembly v1.0 | 系統名 | cv. Camarosa |
配列数 | 28 | 染色体数 | 2n = 8x = 56 |
配列長 (bp) | 805,488,706 | N50長 (bp) | 27,809,139 |
遺伝子の数 | 108,087 | 遺伝子数由来ファイル | Fxa_v1.2_makerStandard_proteins_woTposases_mod.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 108,087 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, 10X, PacBio | 取得した配列量 | 615x |
アセンブリ方法 | DenovoMAGIC3, HiRise pipeline, PBJelly | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 813 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Patrick P. Edger (Michigan State University), Steven J. Knapp (University of California_Davis) | データソース名 | GDR: Genome Database For Rosaceae |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41588-019-0356-4 | データソースURL | https://www.rosaceae.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.4%[S:4.2%,D:95.2%],F:0.2%,M:0.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:97.4%[S:9.1%,D:88.3%],F:0.9%,M:1.7%,n:1614 |