配列名:C.maxima_v1_HWB.chromosome
ゲノム配列名 | C.maxima_v1_HWB.chromosome | 系統名 | NA |
配列数 | 10 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 345,779,982 | N50長 (bp) | 40,395,599 |
遺伝子の数 | 42,886 | 遺伝子数由来ファイル | C.maxima_v1_HWB.peptide.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 42,886 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio | 取得した配列量 | 426x |
アセンブリ方法 | HGAP v. 2.3 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 380 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Qiang Xu (Huazhong Agricultural University) | データソース名 | Citrus Genome Database |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ng.3839 | データソースURL | https://www.citrusgenomedb.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.4%[S:97.0%,D:1.4%],F:1.1%,M:0.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.4%[S:65.8%,D:29.6%],F:1.9%,M:2.7%,n:1614 |